Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRODHO43272 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRODHO43272 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRODHO43272 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRODHO43272 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRODHO43272 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRODHO43272 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRODHO43272 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PRODHO43272 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRODHO43272 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRODHO43272 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRODHO43272 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRODHO43272 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRODHO43272 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRODHO43272 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRODHO43272 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRODHO43272 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms