Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FANCAO15360 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FANCAO15360 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FANCAO15360 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FANCAO15360 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FANCAO15360 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FANCAO15360 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FANCAO15360 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FANCAO15360 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FANCAO15360 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCAO15360 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCAO15360 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCAO15360 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCAO15360 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCAO15360 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCAO15360 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCAO15360 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCAO15360 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCAO15360 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCAO15360 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCAO15360 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCAO15360 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCAO15360 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCAO15360 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCAO15360 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCAO15360 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCAO15360 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCAO15360 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCAO15360 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCAO15360 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCAO15360 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCAO15360 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCAO15360 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCAO15360 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FANCAO15360 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCAO15360 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCAO15360 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCAO15360 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCAO15360 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCAO15360 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCAO15360 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCAO15360 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCAO15360 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCAO15360 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCAO15360 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCAO15360 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCAO15360 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCAO15360 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCAO15360 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCAO15360 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCAO15360 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCAO15360 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCAO15360 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCAO15360 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCAO15360 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCAO15360 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCAO15360 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCAO15360 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCAO15360 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCAO15360 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCAO15360 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCAO15360 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCAO15360 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCAO15360 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCAO15360 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCAO15360 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCAO15360 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCAO15360 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCAO15360 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCAO15360 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCAO15360 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms