Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms