Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC78A2IDD5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms