Protein–RNA interactions for Protein: A0AVI4

TMEM129, E3 ubiquitin-protein ligase TM129, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM129A0AVI4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM129A0AVI4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms