Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms