Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CHTOPQ9Y3Y2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms