Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms