Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms