Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAX2Q9UIW0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms