Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC17A6Q9P2U8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.1 ms