Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA4BQ9NPR2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms