Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00597Q9H2U6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms