Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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