Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS3Q9BQ31 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms