Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCORQ96JN0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms