Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms