Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms