Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC21AQ8NDW8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TTC21AQ8NDW8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TTC21AQ8NDW8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TTC21AQ8NDW8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TTC21AQ8NDW8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC21AQ8NDW8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC21AQ8NDW8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC21AQ8NDW8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC21AQ8NDW8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC21AQ8NDW8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms