Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
P3H3Q8IVL6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
P3H3Q8IVL6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
P3H3Q8IVL6 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
P3H3Q8IVL6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
P3H3Q8IVL6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
P3H3Q8IVL6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
P3H3Q8IVL6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
P3H3Q8IVL6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
P3H3Q8IVL6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
P3H3Q8IVL6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms