Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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USP31Q70CQ4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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USP31Q70CQ4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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USP31Q70CQ4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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USP31Q70CQ4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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USP31Q70CQ4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP31Q70CQ4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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