Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.213e-8■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.783e-8■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 R3HCC1-206ENST00000520480 569 ntTSL 312.33□□□□□ -0.449e-7■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 R3HCC1-209ENST00000523720 629 ntTSL 510.2□□□□□ -0.789e-7■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 ARID1B-214ENST00000636227 6386 ntTSL 57.42□□□□□ -1.229e-7■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 ARID1B-215ENST00000636254 3848 ntTSL 56.92□□□□□ -1.39e-7■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 RP9-202ENST00000448915 629 ntAPPRIS ALT2 TSL 34.52□□□□□ -1.699e-7■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 SKIV2L-202ENST00000461073 1157 ntTSL 212.34□□□□□ -0.435e-7■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 PMPCA-205ENST00000462616 3341 ntTSL 210.2□□□□□ -0.789e-7■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.342e-10■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 SAR1B-201ENST00000402673 6682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.972e-10■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 SAR1B-202ENST00000439578 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.012e-10■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 SAR1B-203ENST00000502286 548 ntTSL 48.4□□□□□ -1.062e-10■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 SAR1B-207ENST00000505758 670 ntTSL 55.19□□□□□ -1.582e-10■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.563e-7■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.583e-7■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 FOXM1-201ENST00000342628 3475 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.333e-7■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.613e-7■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 PDE8A-209ENST00000558543 644 ntTSL 31.93□□□□□ -2.14e-7■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.324e-6■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.14e-6■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.44e-6■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.554e-6■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 SPG7-221ENST00000569720 909 ntTSL 211.41□□□□□ -0.581e-15■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 TBRG1-202ENST00000438907 842 ntTSL 1 (best)8.31□□□□□ -1.084e-6■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 ZCCHC2-209ENST00000591435 455 ntTSL 30.57□□□□□ -2.326e-11■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 RPLP0-207ENST00000547173 864 ntTSL 37.21□□□□□ -1.262e-8■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 BCL2L12-207ENST00000598979 893 ntTSL 312.92□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.712e-7■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.722e-7■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 BCL2L12-213ENST00000619007 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 ZNF202-201ENST00000336139 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.882e-7■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.513e-7■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.513e-7■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.573e-7■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.643e-7■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 MAP3K4-215ENST00000544041 5444 ntTSL 1 (best)10.71□□□□□ -0.693e-7■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 MAP3K4-207ENST00000490904 5451 ntTSL 1 (best)10.69□□□□□ -0.73e-7■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 SLC25A39-217ENST00000593166 797 ntTSL 313.07□□□□□ -0.326e-9■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 UBR3-204ENST00000430321 5411 ntTSL 53.98□□□□□ -1.772e-7■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 UBR3-202ENST00000392632 5129 ntTSL 53.38□□□□□ -1.872e-7■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 DHRS11-212ENST00000612538 756 ntTSL 521.32■■□□□ 12e-7■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 ZKSCAN8-203ENST00000536028 1052 ntTSL 25.81□□□□□ -1.481e-18■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 FARP2-216ENST00000478489 617 ntTSL 317.14■□□□□ 0.333e-7■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.511e-10■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 NAXD-203ENST00000470164 2377 ntTSL 211.71□□□□□ -0.541e-10■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.571e-10■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 FARP2-213ENST00000473082 397 ntTSL 34.58□□□□□ -1.683e-7■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 THUMPD2-206ENST00000527689 210 ntTSL 36.04□□□□□ -1.446e-10■■■■■ 29.3
PRPF8Q6P2Q9 PLEKHH1-215ENST00000561370 1820 ntTSL 214.28□□□□□ -0.121e-9■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 PLEKHH1-212ENST00000560100 638 ntTSL 48.72□□□□□ -1.011e-9■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 PLEKHH1-204ENST00000558296 605 ntTSL 47.24□□□□□ -1.251e-9■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 ATXN2-212ENST00000492467 887 ntTSL 58.14□□□□□ -1.113e-8■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 NUP50-207ENST00000424634 579 ntTSL 315.89■□□□□ 0.135e-8■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 NUP50-208ENST00000430547 537 ntTSL 415.08■□□□□ 05e-8■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 NUP50-210ENST00000434760 763 ntTSL 413.72□□□□□ -0.215e-8■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 NUP50-219ENST00000497960 986 ntTSL 213.11□□□□□ -0.315e-8■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 NUP50-215ENST00000484186 431 ntTSL 58.06□□□□□ -1.125e-8■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 AC003002.4-201ENST00000596617 536 ntAPPRIS P1 TSL 49.5□□□□□ -0.894e-8■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 AC003002.4-203ENST00000596400 630 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.944e-8■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.184e-7■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 SLC38A1-205ENST00000548979 543 ntTSL 47.08□□□□□ -1.285e-7■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 AP1G1-213ENST00000566179 562 ntTSL 50.41□□□□□ -2.349e-12■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.214e-7■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.234e-7■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.394e-7■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.464e-7■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.514e-7■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 NFYC-211ENST00000427410 1379 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.994e-7■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 NFYC-213ENST00000447388 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.124e-7■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 NFYC-203ENST00000372652 2363 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.344e-7■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 RASGRF2-202ENST00000502677 2752 ntTSL 27.47□□□□□ -1.218e-7■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 WSB1-202ENST00000348811 1611 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.762e-10■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 WSB1-201ENST00000262394 5139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.072e-10■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 WSB1-204ENST00000467843 4187 ntTSL 1 (best)7.91□□□□□ -1.142e-10■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 WSB1-216ENST00000584114 479 ntTSL 32.94□□□□□ -1.942e-10■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 WSB1-212ENST00000583096 834 ntTSL 32.6□□□□□ -1.992e-10■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 GCN1-206ENST00000549815 543 ntTSL 311.6□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 REV3L-205ENST00000422377 10964 ntTSL 211.72□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 REV3L-202ENST00000368802 10701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.952e-6■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.432e-6■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 REV3L-206ENST00000434009 10644 ntTSL 22.5□□□□□ -2.012e-6■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 USP39-219ENST00000496047 554 ntTSL 35.47□□□□□ -1.533e-12■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.354e-7■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.276e-7■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 HDAC2-203ENST00000518690 564 ntTSL 519.17■□□□□ 0.664e-7■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 HDAC2-214ENST00000523240 557 ntTSL 519.17■□□□□ 0.664e-7■■■■■ 29.2
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 1590 ms