Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATL3Q6DD88 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATL3Q6DD88 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATL3Q6DD88 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATL3Q6DD88 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATL3Q6DD88 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATL3Q6DD88 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 274.1 ms