Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms