Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms