Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZBED5Q49AG3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED5Q49AG3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED5Q49AG3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED5Q49AG3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED5Q49AG3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED5Q49AG3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED5Q49AG3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED5Q49AG3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED5Q49AG3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED5Q49AG3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED5Q49AG3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED5Q49AG3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZBED5Q49AG3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms