Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms