Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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