Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD2Q16342 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms