Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC6Q16204 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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