Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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NEDD8Q15843 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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