Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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SIX1Q15475 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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SIX1Q15475 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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SIX1Q15475 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
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