Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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