Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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RAB3GAP1Q15042 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB3GAP1Q15042 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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