Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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