Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFFO1Q0D2I5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms