Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms