Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TLE4Q04727 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLE4Q04727 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms