Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms