Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTCQ00610 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms