Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VLDLRP98155 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms