Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms