Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PGGT1BP53609 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PGGT1BP53609 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PGGT1BP53609 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PGGT1BP53609 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP53609 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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