Protein–RNA interactions for Protein: P52907

CAPZA1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA1P52907 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPZA1P52907 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPZA1P52907 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPZA1P52907 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPZA1P52907 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPZA1P52907 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPZA1P52907 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CAPZA1P52907 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPZA1P52907 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPZA1P52907 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPZA1P52907 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPZA1P52907 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPZA1P52907 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPZA1P52907 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPZA1P52907 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPZA1P52907 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPZA1P52907 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPZA1P52907 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPZA1P52907 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPZA1P52907 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPZA1P52907 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPZA1P52907 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPZA1P52907 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CAPZA1P52907 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CAPZA1P52907 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CAPZA1P52907 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CAPZA1P52907 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CAPZA1P52907 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms