Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FNTBP49356 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FNTBP49356 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTBP49356 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTBP49356 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNTBP49356 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNTBP49356 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNTBP49356 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNTBP49356 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNTBP49356 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNTBP49356 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNTBP49356 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNTBP49356 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTBP49356 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTBP49356 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTBP49356 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTBP49356 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTBP49356 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTBP49356 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTBP49356 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTBP49356 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTBP49356 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTBP49356 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTBP49356 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTBP49356 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTBP49356 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTBP49356 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTBP49356 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTBP49356 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTBP49356 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTBP49356 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTBP49356 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTBP49356 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTBP49356 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTBP49356 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms