Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPGP40121 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAPGP40121 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAPGP40121 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAPGP40121 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAPGP40121 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAPGP40121 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAPGP40121 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPGP40121 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPGP40121 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPGP40121 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPGP40121 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPGP40121 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPGP40121 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPGP40121 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPGP40121 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPGP40121 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPGP40121 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPGP40121 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPGP40121 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPGP40121 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPGP40121 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPGP40121 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms