Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP6P35125 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP6P35125 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP6P35125 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP6P35125 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP6P35125 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP6P35125 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6P35125 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6P35125 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6P35125 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6P35125 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6P35125 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6P35125 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6P35125 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6P35125 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6P35125 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6P35125 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6P35125 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6P35125 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6P35125 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6P35125 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6P35125 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6P35125 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6P35125 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6P35125 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6P35125 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6P35125 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6P35125 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6P35125 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP6P35125 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6P35125 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6P35125 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6P35125 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6P35125 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6P35125 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6P35125 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6P35125 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6P35125 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6P35125 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6P35125 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6P35125 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6P35125 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6P35125 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6P35125 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6P35125 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6P35125 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6P35125 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6P35125 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6P35125 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP6P35125 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP6P35125 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP6P35125 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP6P35125 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6P35125 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6P35125 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6P35125 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6P35125 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6P35125 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6P35125 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6P35125 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6P35125 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6P35125 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6P35125 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms