Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms