Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms