Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTAFRP25105 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms